Mempertimbangkan bahwa SDIT Al-Hikam telah meluluskan sebanyak 6 angkatan sejak berdirinya tahun 2006, maka pada 2017 YPPT Al-Hikam mendirikan lembaga baru setingkat sekolah menengah tingkat pertama yang diberi nama Sekolah Menengah Pertama Islam Terpadu (SMPIT) Al-Hikam. Atas pendampingan yang intensif dari Ibu Hj. Min Handayani, Bapak H. Budiarto, SE.SH, Bapak Habib Idrus Assegaf dan Bapak H. Drs. Asikin, M.Ag dari Yayasan PPT Al-Hikam sejak dari awal perencanaannya, tim pendirian SMPIT Al-Hikam yang diketuai Ustadz Ahmad Sunawi, S.Ag.,M.PI dengan anggota Ust. Ir. H. Moh. Kholid Ismail, Ustz. Nur Faizah, S.Ag.,S.Pd, Ust.Lukman Abdul Azis, S.Pd.I.,M.Pd, Ust. Winarno, S.HI, Ust. Sutarjo, S.Pd dan Ustz. Dyah Widyastuti, S.Pd ini akhirnya dapat mewujudkan embrio terbentuknya SMPIT Al-Hikam.

Maka pada tanggal 3 April 2017 diterbitkanlah SK Ketua YPPT Al-Hikam No. 07/01/A-1/IV/2017 tentang Pendirian SMPIT Al-Hikam. Sedangkan pengesahan operasonal awal SMPIT Al-Hikam mengacu pada hasil visitasi petugas dari Dinas Pendidikan dan Kebudayaan Kabupaten Boyolali pada tanggal  26 September 2018. Sebagai kepala sekolahnya YPPT Al-hikam mengangkat Ustadz Lukman Abdul Azis, S.Pd.I.,M.Pd dibantu Ustadz Rohmat Irawan, S.Pd.I dan Ustadzah Diyah Widyastuti,S.Pd sebagai guru. Sedangkan jumlah siswa pada tahun pertama dibuka sebanyak 21 siswa.

Berikutnya pada 21 Desember 2020, alhamdulillah SMPIT Al-Hikam secara resmi mendapatkan ijin operasional penuh melalui Surat Keputusan Kepala Dinas Penanaman Modal dan Pelayanan Terpadu Satu Pintu Kabupaten Boyolali No. 503/2015 tahun 2020.